يمكن أن يحدث التأخير في النقل البحري في مراحل مختلفة من السلسلة اللوجستية، بدءاً من وقت الحجز وحتى التسليم النهائي. بشكل شامل، يمكن تصنيف أسباب ذلك في عدة فئات رئيسية:
1. العوامل البيئية والطبيعية
2. الازدحام والقيود المينائية
3. المشاكل المتعلقة بخطوط الشحن
4. المشاكل الفنية للسفينة والمعدات
5. المشاكل المستندية والجمركية
6. المشاكل المتعلقة بالبضائع
7. المشاكل اللوجستية والتشغيلية
8. المشاكل المالية والتعاقدية
9. مشاكل المسافنة (Transshipment)
10. العوامل البشرية
11. العوامل الأمنية والسياسية
12. حالات الطوارئ والأحداث العالمية